Žádná operace mozku nevytváří schizofrenii. V minulosti předtím, než existovaly účinné léky k léčbě schizofrenie, lékaři někdy používali operaci nazývanou lobotomie a jiné hrubé chirurgické postupy k odpojení čelních lalůček od zbytku mozku. Čelní laloky se podílejí na projevu osobnosti a společenské interakce.
Tyto chirurgické postupy - prováděné převážně ve čtyřicátých letech minulého století - byly používány k ovládání rozrušeného chování nebo k léčbě neklidných přetrvávajících symptomů. Nicméně, jakmile byly k dispozici účinné léky a lékaři si uvědomili škodu způsobenou emocionálnímu životu a osobám pacientů s lobotomií, operace vypadla z laskavosti. Tyto postupy se dnes nepoužívají.